Фамилия Кайшев образована от прозвища, в основе которого лежит турецкое слово kaysa – «обвал, оползень». Согласно другой версии, оно происходит от слова «кайыш», которое в шорском (южно-сибирском) языке имеет значение «кожа», а в киргизском – «гнуться, сгибаться», «ремень».