Фамилия Кабышев в своей основе восходит к тюркскому прозвищу Габыш, что указывает на восточные корни её носителей. Это не единичный случай: многие русские фамилии с суффиксом -ев образованы от тюркских личных имён или прозвищ, которые в XV–XVII веках активно проникали в русскую среду через служилых людей и крестьян.

В прозвище Габыш можно выделить два компонента: «gabi» и «bes». Первый из них в ряде тюркских наречий означает «глуповатый», «недалёкий». Второй — «пятый». Соединяя эти значения, получаем логичную бытовую картину: так могли прозвать пятого ребёнка в семье, который, по наблюдениям окружающих, усваивал новое медленнее других. Прямолинейно, но именно такие прозвища — по порядку рождения и чертам характера — были основой многих древних фамилий.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Кабышев — сын Кабыша (или Габыша). Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ, оканчивающихся на шипящий или мягкий согласный. В данном случае переход тюркского «Габыш» в русское «Кабыш» произошёл из-за особенностей звучания: начальный звонкий «г» в русском языке часто заменялся глухим «к».

В отличие от многих фамилий, у Кабышева нет вариантов с суффиксом -ин или -ский, что говорит о его крестьянском или служилом происхождении — такие фамилии редко давали дворянам. Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале, где исторически были сильны тюркско-славянские контакты.