Фамилия Кайсиди — редкий пример пересечения нескольких языковых и культурных традиций. Её основа восходит к тюркскому имени Кайс, которое, в свою очередь, заимствовано из арабского языка. Арабское слово «кайс» означает «твердый». Нарекая сына именем Кайс, родители желали, чтобы он вырос сильным, стойким и мужественным — это типичная для многих культур модель имянаречения по желаемому качеству.

Сама фамилия Кайсиди образована по греческой модели. Суффикс -иди (или -ди) — характерный признак греческих фамилий, особенно распространённых среди понтийских греков и греков Причерноморья. Он указывает на происхождение или принадлежность: буквально «из рода Кайса», «сын Кайса». Такая модель образования фамилий широко бытовала в Малой Азии и на юге России.

Таким образом, фамилия Кайсиди — результат скрещивания тюрко-арабского имени с греческим патронимическим суффиксом. Это говорит о том, что её носители, скорее всего, были греками, жившими в тюркоязычной среде (например, в Османской империи) или имевшими тесные контакты с тюркскими народами. Встречается она преимущественно в среде понтийских греков, а в России и на Украине — у потомков греческих переселенцев из Крыма и Приазовья. Других версий происхождения, заслуживающих серьёзного рассмотрения, у этой фамилии нет: арабский корень и греческий формант объясняют её форму полностью и без натяжек.