Кайтаненко — фамилия, которая сразу выдает украинское происхождение суффиксом -енко. В украинской ономастике этот формант означает «маленький» или «потомок», то есть буквально «сын Кайтана» или «маленький Кайтан». Но вот с корнем всё не так прозрачно.

Самая вероятная версия — фамилия образована от прозвища Кайтан, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «кайтан» (или «кейтан»). В крымскотатарском и турецком языках «кайтан» означает шнурок, тесьму, плетеный пояс. Прозвище могли дать торговцу галантереей, шорнику, который плел конскую упряжь, или просто человеку, который любил щеголять с плетеным кушаком. Тюркские заимствования в украинских фамилиях — обычное дело для южных и восточных регионов, где веками жили рядом с ногайцами, татарами и турками.

Менее распространенная версия выводит корень из греческого «кайтан» — так называли особый вид плетеной рыболовной сети. В этом случае предок мог быть рыбаком на Азовском или Черном море. Но здесь меньше лингвистических подтверждений, так как греческий след в фамилиях на -енко встречается реже.

Географически фамилия тяготеет к Полтавской, Харьковской и Запорожской областям — регионам, где в XVII–XVIII веках активно селились запорожские казаки. Казаки часто брали фамилии по роду занятий или по внешним признакам, и прозвище Кайтан вполне вписывается в их бытовой и военный обиход (тесьма и шнуры использовались в амуниции).

В дореволюционных метрических книгах фамилия встречается в написании «Кайтаненко» без вариантов — это говорит о том, что она сложилась в письменном виде уже к середине XIX века. Двойных форм вроде «Кайтаненков» не зафиксировано, что типично для украинских фамилий, которые не русифицировались.