Фамилия Казаногина — редкий случай, когда суффикс -ин указывает на женскую форму, но сама основа фамилии заставляет задуматься. Мужской вариант — Казаногин. В русских фамилиях суффикс -ин обычно присоединяли к основам на -а/-я (сын кого? — Кузьмин, Ильин). Здесь же основа «Казаног» — нестандартная, что сразу намекает на иноязычное или диалектное происхождение.

Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «казан» — котёл. В татарском, башкирском, казахском языках «казан» — это не только посуда для варки, но и символ очага, достатка. Вторая часть «-ог» может быть искажённым тюркским «оглы» (сын) или русским суффиксом, переосмысленным на слух. То есть Казаног — «сын Казана» (человека по прозвищу Котёл) или «тот, кто делает казаны». Прозвище Казан давали либо мастерам-котёльщикам, либо людям с крупным телосложением, либо тем, кто варил еду для большой семьи.

Есть и другая, более прозаичная версия. Фамилия могла возникнуть из прозвища Казанога — человека, у которого нога похожа на казан (опухшая, толстая) или который хромал, подволакивая ногу, как котел. Такие бытовые прозвища по частям тела в русских деревнях были обычны. Однако суффикс -ин в этом случае образовывал бы фамилию от прозвища на -а (Казанога → Казаногин), что грамматически верно.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Приуралью — регионам, где веками жили рядом русские и тюркские народы. Встречается она редко, в основном в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Это не дворянская и не купеческая фамилия — скорее, крестьянская или мещанская, возникшая в среде, где языки смешивались, а прозвища давали по ремеслу или внешности. Современные носители, скорее всего, потомки тех, кто в XVIII-XIX веках получил фамилию по отцу или деду, которого звали Казан или Казанога.