Фамилия Кельдуганова — женская форма фамилии Кельдуганов, и её разбор стоит начать с основы, которая встречается нечасто. В отличие от фамилий на -ов/-ев, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), или на -ин от прозвищ (Пушкин), здесь мы видим редкую тюркскую основу, что сразу указывает на географию: скорее всего, предки носительницы жили в регионах Поволжья, Приуралья или на Северном Кавказе, где столетиями соседствовали русские и тюркские народы.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов (в женском роде -ова) присоединён к основе Кельдуган. Сама основа, вероятно, восходит к тюркскому прозвищу или имени. Можно разобрать её на две части: «кель» и «дуган». В тюркских языках «кель» часто означает «приходи» (повелительное наклонение от глагола «приходить»), а «дуган» — «рождённый» (причастие от глагола «рождаться»). Таким образом, Кельдуган могло означать «пришёл родившийся» или «рождённый, чтобы прийти» — типичное для степной культуры имя-пожелание, которое давали ребёнку, появившемуся на свет в дороге, в пути, или же как символическое пожелание удачной судьбы.

Другая, менее вероятная версия связывает «кель» с названием рыбы (к примеру, в казахском «көл» — озеро, но это уже иное звучание). Однако вариант с глагольной формой выглядит убедительнее, поскольку в тюркской ономастике много имён, построенных как короткие фразы (например, Кельмамат — «пришёл Мамат»). Фамилия Кельдуганов, следовательно, не имеет отношения к русским корням и не происходит от календарного святца — это прямой след межэтнических контактов, когда тюркское прозвище закрепилось как фамилия у русского или обрусевшего населения.

Сам суффикс -ов в этой фамилии указывает на то, что оформление происходило по русской модели, скорее всего, в XVIII–XIX веках, когда крестьянам и казакам массово давали фамилии. Сословно носители Кельдугановых, судя по отсутствию дворянских гербов, были из крестьян, мещан или казачества — именно в этих средах тюркские прозвища легко переходили в фамилии. Сегодня фамилия редкая, её можно встретить в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области и среди ногайцев.