Фамилия Кергина — женская форма, а её мужской вариант — Кергин. Сразу бросается в глаза финаль -ин, один из самых распространённых русских фамильных суффиксов. Он указывает на принадлежность: «чей?» — Кергин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Керга.

Сам корень — «керг» — в русском языке не встречается. Это главная загадка фамилии. Скорее всего, он заимствован из тюркских или финно-угорских языков, что типично для фамилий, возникших в Поволжье, на Урале или в Сибири, где русские соседствовали с другими народами.

Самая вероятная версия — происхождение от коми-пермяцкого или удмуртского слова «кер» (керӧ), что означает «бревно», «лес» или «дерево». Суффикс -га в этих языках мог придавать слову дополнительный оттенок, образуя прозвище Керга — «лесной человек», «дровосек» или «тот, кто живет в лесу». В таком случае предок носителя фамилии мог быть лесорубом, плотником или просто жителем глухой лесной местности.

Вторая версия, менее распространенная, но тоже имеющая право на существование, связывает Кергина с тюркским словом «кергек» (в некоторых диалектах «кергә»), означающим «нужный», «необходимый». Прозвище Керга могли дать полезному, незаменимому человеку в общине. Однако эта гипотеза слабее, так как в тюркских языках слово чаще употребляется в форме «кергек» или «керек», а не «керга».

Встречается фамилия и в написании через букву «а» — Каргин. Это не ошибка, а результат региональных диалектных особенностей произношения: в некоторых говорах безударное «е» переходило в «а». Поэтому обе формы — Кергин и Каргин — могут быть однокоренными и означать одно и то же.

Сословной принадлежности у фамилии нет: она встречается и у крестьян, и у мещан, и у казаков. В архивных записях XVIII–XIX веков Кергины фиксируются в Вятской губернии, Пермской губернии и на Урале — как раз в зоне расселения коми-пермяков. Это косвенно подтверждает «лесную» версию происхождения.