Фамилия Хабибьянов — это, скорее всего, фонетический вариант более распространённой фамилии Хабибджанов. Такое изменение произошло из-за особенностей произношения: звукосочетание «дж» в потоке речи упростилось до мягкого «й». Поэтому, анализируя происхождение, мы обращаемся к исходной форме.

В основе обеих фамилий лежит составное мужское имя Хабибджан. Оно соединило в себе два элемента. Первый — арабское имя Хабиб, которое переводится как «любимый», «друг». Второй — персидский компонент «джан», означающий «душа», «жизнь», а в составе имён — ласковое обращение («дорогой», «милый»). Вместе они складываются в поэтичное значение «любимая душа» или «дорогой сердцу друг».

Такие двусоставные имена с компонентом «джан» были очень популярны в тюркской среде, особенно в Средней Азии. Они выражали пожелание ребёнку долгой жизни и всеобщей любви.

Сама фамилия образовалась по классической русской модели: к основе Хабибьян (упрощённой от Хабибджан) добавили притяжательный суффикс -ов. Первоначально такая форма отвечала на вопрос «чей?» и означала «сын Хабибджана». Со временем она закрепилась как наследственное родовое имя.

Таким образом, носитель фамилии Хабибьянов — это потомок человека по имени Хабибджан, чьё имя с арабского и персидского можно перевести как «любимая душа». В написании с буквой «й» вместо «дж» отразилась живая разговорная традиция, которая со временем победила в документах.