Фамилия Хабипова — женская форма от мужской фамилии Хабипов, которая образована от арабского имени Хабиб. В переводе с арабского «хабиб» означает «любимый», «друг», «возлюбленный». Это одно из имён, связанных с корнем «хбб» (любовь), широко распространённое в мусульманском мире. В русской среде аналогичным по смыслу можно считать имя Любим, от которого пошли фамилии Любимов, Любимцев.

Модель образования фамилии Хабипова довольно прозрачна: к основе Хабиб добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Однако в написании фамилии есть тонкость. В исходном арабском имени на конце твёрдый звук «б», и по правилам русской транскрипции логичнее было бы писать Хабибов. Вариант Хабипов (с глухим «п» вместо звонкого «б») — это результат адаптации через тюркские языки, где в конце слова звонкий согласный часто оглушается. Например, в татарском или башкирском имя Хабиб на слух произносится как «Хабип». Поэтому фамилии Хабипов и Хабипова характерны прежде всего для татар, башкир и других тюркоязычных народов Поволжья и Урала, исповедующих ислам. Встречаются они и у кавказских народов, но там чаще сохраняется форма Хабибов.

Сословно предки носительницы фамилии Хабипова могли быть кем угодно — от крестьян до купцов и духовенства. Фамилия не указывает на знатное происхождение, но говорит о том, что родоначальник носил имя Хабиб. В мусульманской среде это имя давали в честь пророка Мухаммеда (одно из его прозвищ — Хабибулла, «любимец Аллаха»), так что имя было почётным и распространённым.

Если сравнивать с однокоренными русскими фамилиями, то Хабипова стоит в одном ряду с Хабибуллиным (Хабибулла — «любимец Аллаха») и Хабибрахмановым (Хабиб ар-Рахман — «любимый Милостивым»). Все они восходят к одному корню, но Хабипова — самая краткая форма, без дополнительных религиозных эпитетов.