Фамилия Хабибова образована от мужского имени Хабиб, в основе которого лежит арабское слово «habibi», то есть «любимый, друг». Вероятно, такое имя родители дали своему долгожданному, любимому сыну. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Хабибовых можно лишь на основании генеалогических исследований.