Фамилия Хабибова — женская форма фамилии Хабибов, которая восходит к мужскому личному имени Хабиб. Это имя имеет арабские корни и переводится как «любимый», «друг», «возлюбленный». В арабском языке слово «хабиб» (от формы «хабиби» — «мой любимый») является одним из эпитетов, которым награждали дорогого сердцу человека. Вероятно, родители дали такое имя долгожданному или особенно любимому сыну, вкладывая в него пожелание, чтобы ребенок был окружен любовью и дружбой на протяжении всей жизни.

Имя Хабиб широко распространено у народов, исповедующих ислам, — у татар, башкир, народов Кавказа, а также у арабов и тюркских народов. В русскоязычной среде фамилия Хабибова встречается преимущественно в Поволжье, на Урале и в регионах Северного Кавказа, что отражает исторические ареалы расселения этих этнических групп.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русских фамилий, образованных от восточных имен: к основе «Хабиб» добавляется патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова), который изначально указывал на принадлежность к отцу. Таким образом, Хабибов — это «сын Хабиба», а Хабибова — «дочь (или жена) Хабиба». Эта модель аналогична фамилиям, образованным от славянских имен (Иванов, Петров) и от других заимствованных имен (Ибрагимов, Юсупов).

Процесс формирования фамилий у разных народов был длительным. У русских фамилии в привычном виде закрепились к XVII–XVIII векам, а у тюркских и кавказских народов, принявших русскую модель именования, они нередко оформлялись позже, в XIX — начале XX века. Поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Хабибовых можно лишь на основании генеалогических исследований, которые учитывают историю конкретной семьи, ее миграции и документы.

В арабской традиции имя Хабиб встречается и в составе теофорных имен, например Абдул-Хабиб («раб Любимого», то есть Бога), что еще раз подчеркивает его сакральный оттенок. Однако в большинстве случаев фамилия Хабибова происходит именно от самостоятельного имени, без религиозного контекста, и несет в себе теплое, личное значение — память о том, что предка этого рода когда-то назвали «любимым».