Фамилия Халепина — женская форма мужской фамилии Халепин. Её основа восходит к прозвищу или нецерковному имени Халепа. В русских говорах слово «халепа» означало «беда», «неприятность», «напасть» (ср. украинское «халепа» — то же самое). Скорее всего, так в народе называли невезучего человека, на которого постоянно сваливались несчастья, или, напротив, в качестве охранительного имени — чтобы злые силы обходили ребёнка стороной, думая, что он и так уже «плохой» и несчастный.

Фамилия образована по продуктивной модели с суффиксом -ин, который в русском языке указывает на принадлежность: Халепин — сын Халепы. Интересно, что слово «халепа» могло иметь и диалектные оттенки. В некоторых областях так называли не только беду, но и неопрятного, неряшливого человека. В этом случае прозвище получал тот, кто ходил в рваной одежде или не следил за хозяйством.

Географически фамилия Халепин (и Халепина) тяготеет к южнорусским и украинским территориям, где слово «халепа» было особенно употребительным. Встречается она и в центральных областях России, но реже. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с такой фамилией, что указывает на её давнее бытование в непривилегированных сословиях.

Сравнение с однокоренными фамилиями (например, Халепов, Халепкин) показывает, что основа «халеп» не утратила связи с исходным значением. В отличие, скажем, от фамилии Беда, которая тоже образована от слова с негативным смыслом, Халепин сохранила более узкий диалектный оттенок, что делает её особенно ценной для историков языка.