Фамилия Халгатян — почти стопроцентный маркер армянского происхождения. Её выдают суффиксы -ян (или -ан), которые в армянской ономастике выполняют ту же роль, что русские -ов/-ев: указывают на принадлежность роду или потомка. В диаспоре, особенно на юге России, написание могло колебаться между Халгатян и Халгатъян, но исходная форма — именно с -ян.

Корень фамилии — «Халгат» (Халгад). В армянском языке это слово многозначно, и тут начинается самое интересное. Первая версия: «халгат» — диалектное название плуга или сохи, то есть основатель рода мог быть пахарем, земледельцем. Вторая, более вероятная, отсылает к прозвищу «халгат» — так в некоторых говорах называли человека с быстрой, порывистой походкой, «летуна», «торопыгу». В армянских фамилиях прозвища по характеру или внешности встречаются не реже, чем по профессии.

Третья, менее распространённая гипотеза связывает «Халгат» с тюркским «калгат» (ошибка, оплошность) — но это сомнительно: армянские фамилии с тюркской основой обычно оканчиваются на -ов или вовсе не имеют суффикса, а -ян здесь указывает на исконную армянскую словообразовательную модель.

Географически фамилия Халгатян — редкая. Она не входит в списки самых частых армянских фамилий (вроде Аветисян, Григорян) и, скорее всего, локализована в одном-двух сёлах исторической Западной Армении (ныне восток Турции) или среди потомков выходцев из тех краёв. В России носители встречаются в Краснодарском крае и Ростовской области — традиционных местах расселения армянской диаспоры. Сословной принадлежности по фамилии не определить: армянские фамилии на -ян в XIX веке носили и крестьяне, и ремесленники, и купцы.