Фамилия Халистонов — одна из тех, где за необычным звучанием скрывается довольно прозрачная, но неочевидная на первый взгляд история. Чтобы понять её корни, нужно отбросить современное окончание -ов и присмотреться к основе «Халистон».

Скорее всего, перед нами патроним (фамилия по отцу), образованный от имени или прозвища Халистон. Само слово «Халистон» — это, в свою очередь, русская народная форма греческого имени Харитон. В греческом «харис» означает «милость», «благодать», «красота». В русских говорах имя Харитон часто «обкатывалось» до более простых вариантов: Харитон — Харитоша — Халистон. Встречаются и другие вариации, например, Халист или Халимон, но суффикс -он указывает на уменьшительно-ласкательный или обиходный вариант имени. Таким образом, Халистонов буквально означает «сын Халистона», то есть потомок человека, которого в быту называли Халистоном вместо полного церковного имени Харитон.

Суффикс -ов в фамилии — стандартный русский патронимический показатель, указывающий на принадлежность. Он характерен для основной массы русских фамилий, сформировавшихся в центральных регионах России в XVI–XVII веках. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывались от основ на -а/-я, -ов крепился к основам на согласный.

Географически фамилия Халистонов редкая и имеет выраженную привязку к югу России, в частности к Ростовской области и Краснодарскому краю. Встречается она и в Поволжье, что неудивительно: имя Харитон было популярно в крестьянской и купеческой среде, а его народные формы разошлись по всей территории расселения русских. Социальный контекст здесь прост: предки носителей фамилии — скорее всего, крестьяне или мещане, поскольку в дворянской соде предпочитали более книжные, полные формы имён.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия, связывающая фамилию с тюркским корнем «халыс» (чистый, искренний). Однако она разбивается о простой факт: в русских фамилиях на -ов от тюркских основ мы бы ждали форму «Халысов», а не «Халистонов». Лишний слог -тон- явно указывает на славянскую переработку греческого имени. Поэтому версия с Харитоном — основная и наиболее обоснованная.