Фамилия Халымов в русском языке — одна из тех, где прозрачная основа сразу подсказывает вероятное происхождение. В её основе лежит слово «халым» — так в южных и центральных регионах России называли взятку, побор, незаконную мзду. Соответственно, прозвище Халым мог получить человек, который брал взятки (например, приказчик или чиновник) или, наоборот, был вынужден их давать. Слово тюркского происхождения (сравните с казахским «қалым» — выкуп за невесту, калым), но в русских говорах оно закрепилось именно в значении «незаконный доход», «поборы» или даже «неправедно нажитое добро».

Суффикс -ов указывает на стандартную русскую патронимическую модель: Халымов — сын Халыма. Фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени — в святцах такого имени нет. Это значит, что предок носителя фамилии был известен в своей среде именно этой чертой, и прозвище закрепилось за его потомками в качестве родового имени.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям и Поволжью, где были сильны тюркские языковые влияния. Встречается она нечасто, что типично для прозвищ с отрицательным оттенком: такие фамилии реже становились массовыми, так как их носители при первой возможности могли сменить неблагозвучное прозвание. В дореволюционных переписях Халымовы могли записываться в среде крестьян и мещан, но, учитывая семантику основы, прозвище могло возникнуть и в среде мелких чиновников или торговцев, где подобные «халымные» практики были распространены.

В ономастической литературе фамилия не получила развёрнутого толкования, но её значение однозначно укладывается в ряд русских «нелестных» прозвищ, ставших фамилиями: Взяточников, Мздоимец, Корытов. Отметим, что в некоторых диалектах «халым» могло означать и просто «шум», «суета» или «беспорядок», но основная и наиболее убедительная версия — коррупционная.