Фамилия Ханкишизаде образована от восточного имени Ханкиши при помощи суффикса –заде, означающего «сын». Этот суффикс свойственен выходцам из Персии, которые в частности проживают на территории Узбекистана, Таджикистана, Азербайджана. Причем, как правило, речь идет о выходцах из знатных родов. Имя Ханкиши имеет сложную структуру и состоит из двух частей. Первая их них — Хан — представляет собой древнетюркско-татарское имя, которое переводится как «повелитель, властелин». Первоначально слово «хан» употреблялось как титул человека, объединявшего одну кровь, вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). В монгольской империи это титул главы государства, начиная с Чингизхана. Со временем это слово превратилось в антрополексему и стало использоваться при образовании восточных составных имен. Второй компонент имени - «киши» - в тюркском языке означает «малый», «младший». Таким образом, имя Ханкиши в буквальном смысле переводится как «младший правитель». Вероятно, родители, нарекая своего своего ребенка именем Ханкиши, желали ему ханской власти и богатства.