Фамилия Харышин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. На первый взгляд её можно принять за типичную «маленькую» фамилию с суффиксом -ин, образованную от личного имени или прозвища. Но с основой «Харыш» всё сложнее.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»). Харышин — «сын Харыша» или «человек из семьи Харыша». Вопрос в том, что такое «Харыш». В русских говорах и ономастиконе такого корня нет. Это сразу наводит на мысль о заимствовании.

Наиболее вероятная версия — тюркское происхождение. В татарском, башкирском, казахском языках есть корень «хары» или «кары», означающий «старый», «почтенный», «уважаемый». Сравните с татарским «кары» (старик, старейшина) или «карый» (старый). Форма «Харыш» могла быть прозвищем старшего, мудрого человека или старейшины рода. Суффикс -ыш в тюркских языках часто образует имена и прозвища (ср. татарские фамилии на -ышов, -ишев). Таким образом, Харыш — это, скорее всего, прозвище, данное по возрасту или социальному статусу.

Менее вероятна, но возможна связь с арабским «харис» (страж, хранитель) или «хариш» (шероховатый, грубый). Однако фонетически «Харыш» ближе к тюркскому варианту, чем к арабскому, где ударение и гласные иные. География фамилии также подтверждает тюркскую гипотезу: Харышины встречаются в Поволжье, на Урале, в Западной Сибири — в регионах активного русско-татарского и русско-башкирского контакта.

Фамилия Харышин — не дворянская и не крестьянская в привычном смысле. Скорее всего, она принадлежала к служилым или ясачным людям, возможно, к так называемым «новокрещенам» — татарам и башкирам, принявшим православие. После крещения их прозвища часто русифицировались с помощью суффикса -ин, а исходная тюркская основа сохранялась. Так что предки носителя фамилии Харышин могли быть степными старейшинами или просто пожилыми, уважаемыми людьми, чье прозвище закрепилось за потомками.