Фамилия Харишина — женская форма фамилии Харишин, которая образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ин. Этот суффикс в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Харишин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Хариша.

Основа фамилии — Хариша. Это уменьшительно-ласкательная или обиходная форма от крестильного имени Харитон. Имя Харитон (от греческого «харис» — милость, благодать) в старину было распространено на Руси, особенно в крестьянской и купеческой среде. В быту Харитонов часто звали Харишами, подобно тому как Иванов звали Ивашами, а Степанов — Стёшами. Соответственно, Харишин — это «сын Хариши», то есть потомок Харитона.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным словом «хариш» или «харыш». В некоторых южнорусских говорах так называли корыстного, жадного человека или, наоборот, того, кто «харит» (делает добро, милует). В таком случае фамилия могла закрепиться за человеком, получившим такое прозвище по характеру. Однако с учётом распространённости суффикса -ин именно от личных имён, версия с Харитоном выглядит предпочтительнее.

Фамилия Харишин (и Харишина) встречается нечасто. Она характерна для центральных и северных областей России, где была сильна традиция «именных» фамилий на -ин. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще обозначали принадлежность к ремеслу или роду занятий, Харишин прямо указывает на конкретное имя предка. Это фамилия, которая говорит о личном, а не о профессиональном прошлом семьи: носительница фамилии Харишина — потомок того самого Хариши, которого в документах могли записать как Харитона.