Фамилия Хайдуковап — один из тех редких случаев, когда написание подсказывает путь к разгадке быстрее, чем произношение. С первого взгляда бросается в глаза нестандартный суффикс -ап, который почти не встречается в русских фамилиях. В русском языке этот элемент не образует фамилий — он явно пришлый. Скорее всего, перед нами результат адаптации нерусской фамилии на русской почве, где конечное -ов приросло к основе, а исходное окончание было переосмыслено.

Вероятнее всего, основа «Хайдук» восходит к слову «гайдук» (или «хайдук»). В балканских и южнославянских языках так называли повстанца, разбойника или народного мстителя, который уходил в леса и горы бороться с османским владычеством. В Венгрии и Речи Посполитой хайдуками (гайдуками) именовали пеших воинов, легкую пехоту или стражников. Таким образом, предок носителя фамилии мог получить прозвище Хайдук либо за буйный нрав и склонность к вольной жизни, либо за службу в гайдуцком отряде.

Сама фамилия Хайдуковап могла сформироваться так: изначально существовала фамилия Хайдук или Хайдука. В славянской среде её «обрусили», добавив типичный суффикс -ов (как в Иванов, Петров). Получилось Хайдуков. Но если исходная форма имела окончание -а (например, в украинской или белорусской традиции фамилии на -а не редкость), то при добавлении -ов возникло сочетание Хайдуков + ап. Буква «п» на конце — скорее всего, искажение от «в» (Хайдуковав) или ошибка писаря. В XIX веке грамотных людей было мало, фамилии записывали на слух, и конечный звук «в» в безударной позиции легко превращался в «п»: Хайдуковап вместо Хайдуковав.

Географически фамилия с такой структурой тяготеет к южнорусским и украинским землям, где исторически оседали выходцы с Балкан, а также к территориям бывшей Речи Посполитой, где служили гайдуки. Встречаемость фамилии крайне низкая — это не массовая, а штучная фамилия, что подтверждает её позднее и случайное оформление. Единственное, что можно сказать с уверенностью: в основе лежит прозвище, связанное с военным или разбойничьим ремеслом, а странное окончание — результат канцелярской ошибки или местного произношения.