Фамилия Хайнин — редкий случай, когда прозрачная на первый взгляд основа оборачивается несколькими разными историями. На слух она кажется «русской» благодаря суффиксу -ин, но корень Хайн- явно не славянского происхождения. Разбираться приходится с географии и этнического контекста, а не с древнерусского прозвища.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин присоединялся к основам на -а или -я, указывая на принадлежность («чей?» — Хайнин, то есть сын или потомок Хайна). Но вот кем был этот Хайн — главный вопрос. Первая и самая вероятная версия связывает фамилию с еврейским ашкеназским именем Хаим (חַיִּים — «жизнь»). В восточноевропейском произношении оно нередко давало варианты Хайм, Хайн, от которых и пошли фамилии Хаймович, Хаймов, Хайнин. В таком случае фамилия — метронимическая или патронимическая, указывающая на предка по имени Хаим.

Вторая версия — тюркская. В башкирском и татарском языках «хайн» (ҡайын) означает «берёза». Прозвище или имя по дереву — распространённая модель у тюркских народов. Если предок носителя фамилии был из татарской или башкирской среды, Хайнин могло возникнуть как русифицированная форма отчества от имени Хайн (Берёза). В пользу этой версии говорит география: фамилия встречается в Поволжье и на Урале, где исторически сильны тюркские общины.

Третья, менее вероятная гипотеза — немецкое происхождение. Фамилия Hain (от средневерхненемецкого hagen — «изгородь», «огороженное место») известна в Германии. Немецкие колонисты, переселявшиеся в Россию в XVIII–XIX веках, могли русифицировать свою фамилию, добавив окончание -ин. Однако для такой фамилии типичнее было бы остаться без суффикса (Хайн) или получить -ов (Хайнов). Вариант Хайнин среди российских немцев редок.

Сословная принадлежность носителей фамилии не зафиксирована в статистике — её обладатели могли быть и мещанами, и крестьянами, и купцами. В дореволюционных метрических книгах Хайнины встречаются в черте оседлости (еврейские местечки Украины и Белоруссии) и в мусульманских приходах Приуралья, что только подтверждает двойственную природу корня.

Спор между версиями решается просто: если предки жили в западных губерниях Российской империи — почти наверняка еврейская фамилия от Хаима. Если корни ведут в Башкирию или Татарстан — тюркская «берёзовая» основа. В любом случае носителю фамилии стоит начать поиск с географии расселения семьи в XIX веке — это сразу отсечёт лишние гипотезы.