Фамилия Хисяев — редкая, и её разбор требует внимания к звуковому облику и возможным тюркским корням. В отличие от фамилий на -ов или -ин, которые часто образованы от славянских прозвищ, Хисяев явно несёт следы восточного влияния. Основа здесь — «Хисяй» (или «Хися»), а суффикс -ев указывает на патронимическое происхождение: «чей?» — Хисяев, то есть сын или потомок человека по имени Хисяй.

Самая вероятная версия — что имя Хисяй восходит к тюркскому мужскому имени Хисай (вариант Хисайя), которое, в свою очередь, заимствовано из арабского через исламскую традицию. Арабское имя Хусайн (уменьшительное от Хасан) в тюркской среде часто давало формы Хисай, Хусай, Хасан. В татарском, башкирском и других тюркских языках Поволжья и Урала подобные имена были распространены, и от них образовывались фамилии на -ев. Таким образом, Хисяев — это «потомок Хисая», где конечное «-я» могло возникнуть из-за местного произношения или адаптации к русской орфографии.

Менее правдоподобна связь с русским диалектным словом «хися» (нечто мелкое, незначительное), так как фамилии от таких прозвищ обычно оформляются суффиксом -ин (Хисин), а не -ев. Кроме того, фамилия Хисяев практически не встречается в центральных русских регионах, её география — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, где фамилии тюркского происхождения с суффиксом -ев обычны.

По сословной принадлежности предки Хисяевых, скорее всего, относились к государственным крестьянам или служилым татарам, которые в XVII–XIX веках, переходя в православие или оставаясь мусульманами, получали фамилии по отцу. Фамилия не дворянская — в родословных книгах Российской империи она не зафиксирована. Сегодня носители фамилии живут в основном в Приволжском федеральном округе, что подтверждает её региональную привязку.