Фамилия Хлапунова — женская форма, а её мужской вариант Хлапунов. С точки зрения словообразования всё прозрачно: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Хлапунов — сын или потомок человека по прозвищу Хлапун. Основа здесь редкая и неочевидная, и именно в ней главная загадка.

Самая вероятная версия связывает прозвище Хлапун с диалектным словом «хлап». В северных и сибирских говорах хлапом называли не только хворост, но и болтуна, пустомелю, человека, который говорит быстро и невнятно, «хлопает языком». Глагол «хлапать» (или «хлопать») в этом контексте означал «болтать, трещать без умолку». Тогда Хлапун — это говорун, пустослов. Подобные прозвища по манере речи давали охотно: в старых писцовых книгах встречаются и Хлопуша, и Хлапушка. Фамилия образована по той же продуктивной модели, что и Болтунов, Говорунов, Ворчунов.

Есть и вторая, менее распространённая гипотеза. В некоторых областях «хлап» могло быть вариантом слова «хлоп» — звук удара или шлепка. В этом случае Хлапун — человек, который хлопает (например, дверью, или же работник, занятый ручным обмолотом — «хлопаньем» цепом). Но эта версия слабее: прозвища по действию чаще образовывались от глагольной основы без суффикса -ун (Хлоп, Хлопец), а суффикс -ун как раз характерен для характеристики человека по его постоянному свойству (болтун, ворчун, крикун). Поэтому версия с болтливостью выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия Хлапунов встречается нечасто. Основные очаги — Вологодская и Архангельская области, что косвенно подтверждает севернорусское происхождение слова «хлап». В центральных и южных регионах она редка. В писцовых и переписных книгах XVI–XVII веков фамилия не фиксируется — это говорит о том, что она возникла не в среде служилого дворянства, а в крестьянской или посадской среде, где прозвища передавались по наследству стихийно и долго не попадали в официальные документы.

Таким образом, Хлапуновы — потомки человека, которого в деревне прозвали за привычку много и громко говорить. Никакого отношения к «хламу» (мусору) фамилия не имеет: слова «хлам» и «хлап» — разных корней, и путать их не стоит.