Фамилия Ходикян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян (или его варианта -янц). Этот суффикс, означающий «принадлежащий роду» или «потомок», в армянской ономастике выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин. Основа фамилии — «Ходик» — с большой вероятностью является уменьшительной формой армянского имени Ходжа или Ходи.

Корень восходит к тюркскому «ходжа» (господин, хозяин, наставник), которое через арабский язык проникло в армянский и другие языки Ближнего Востока. В армянской среде слово «ходжа» часто использовалось как прозвище или титул для купцов, богатых людей или уважаемых старшин. Уменьшительный суффикс -ик придаёт форме оттенок ласкательности или указывает на младшего члена семьи: Ходик — это «маленький Ходжа», «сын Ходжи» или «тот, кого звали Ходжиком».

Таким образом, социальный портрет предка носителя фамилии Ходикян довольно прозрачен: это, скорее всего, выходец из зажиточной или торговой семьи, чей предок имел авторитет в общине и мог носить почётное прозвище Ходжа. Географически фамилия типична для западных регионов исторической Армении (в частности, районов Вана, Муша, Сасуна), а также для армянской диаспоры, сложившейся после геноцида 1915 года.

В русском языке фамилия пишется через «и» — Ходикян, хотя при транслитерации с восточноармянского литературного языка возможен вариант Ходикян (с ударением на последний слог). Важно не путать её с фамилией Ходжикян, где корень может быть связан с именем Ходжа напрямую, без уменьшительного суффикса. Разница в основе — Ходик против Ходжик — указывает на разную ступень словообразования, но обе фамилии восходят к одному и тому же тюрко-арабскому источнику.