Фамилия Хоронеко — редкий пример того, как прозвище, а не крестильное имя, легло в основу родового именования. В её основе лежит прозвище Хорон, которое ведёт начало от глагола «хоронить» — то есть «прятать, класть в потаённое место» или «погребать умершего». Суффикс -енко, характерный для украинской и южнорусской традиции, указывает на принадлежность к роду: Хоронеко буквально означает «сын (или потомок) Хорона».

Смысл прозвища Хорон неоднозначен, и здесь стоит развести несколько версий. Самая распространённая трактовка — охранительная. В семьях, где дети умирали во младенчестве, ребёнку могли дать имя-оберег Хорон, чтобы «спрятать» его от смерти, обмануть злые силы. Такой обычай был широко распространён у славян: считалось, что имя с негативным или нейтральным значением отведёт беду от малыша.

Однако прозвище Хорон могло закрепиться и за взрослым человеком по роду его занятий. Казначей, в чьи обязанности входило хранить и прятать деньги, вполне мог получить такое прозвище. Не менее правдоподобно, что Хороном называли летописца или сказителя — хранителя истории и преданий, который «хоронил» в памяти знания рода. Наконец, не исключено, что прозвище досталось сторожу, чья работа — стеречь и укрывать вверенное имущество.

Позже прозвище Хорон, изначально присоединённое к наследственному имени, полностью заменило его как в повседневной жизни, так и в официальных документах. Так потомки человека по прозвищу Хорон, жившего, вероятно, на территории современной Украины или в южных регионах России, стали Хоронеко.