Фамилия Ховпун образована от аналогичного мирского имени, основой для которого, скорее всего, послужил глагол «хопить». Даля это слово трактуется как «тихо дуть, подувать, веять». Вполне вероятно, что это имя указывает на погоду, которая сопутствовала рождению младенца. По другой версии, фамилия Ховпун происходит от прозвища Ховпун, которое этимологически связано с корнем глагола «халпить», то есть «студить, прохлаждать». Возможно, что данное прозвище получил простуженный человек.