Фамилия Хритонина — женская форма от Хритонин, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса. Суффикс -ин указывает на принадлежность: в русской традиции такие фамилии образовывали от имени или прозвища отца, отвечая на вопрос «чей?». То есть Хритонин — сын или потомок человека по имени или прозвищу Хритоня. Это «патронимическая» модель, одна из самых массовых в северной и центральной России, хотя для женской формы окончание -а просто указывает на носительницу, а не на род занятий.

Основа фамилии — Хритон(я). Это краткая разговорная форма от церковного имени Христофор (в переводе с греческого «несущий Христа») или, реже, от Хрисанф («златоцветный»). В народной среде длинные имена сокращали, добавляя мягкий или ласкательный суффикс: Хритон, Хритоня — так же, как из Григорий получали Гриша, а из Дмитрий — Митя. Фамилия Хритонин, таким образом, ведёт родословную от человека, которого в быту звали Хритоней, а в документах могли записать как Христофор или Хрисанф.

Интересно, что фамилия Хритонин (и Хритонина) встречается редко и имеет выраженную региональную привязку. По данным современных исследований, основная масса носителей сосредоточена в Поволжье — в Самарской, Ульяновской областях и в Татарстане. Это не случайно: в этих краях в XVIII–XIX веках была высока доля старообрядческого населения, которое часто сохраняло архаичные имена и прозвища, реже встречавшиеся в центральных губерниях. Возможно, предки Хритониных были крестьянами или мещанами, но сословная принадлежность по фамилии не реконструируется — слишком мало данных.

Сравнение с однокоренными фамилиями даёт дополнительный штрих. В русских говорах есть фамилии Хритонов, Хритошин, Хритоня — все они восходят к тому же корню. Но Хритонин отличается суффиксом -ин, который в этом случае мог закрепиться из-за окончания основы на -а: Хритоня → Хритонин. Это тонкое, но важное отличие, которое указывает на более личную, «домашнюю» форму имени предка.

Если у вас фамилия Хритонина, то ваши предки по мужской линии, скорее всего, носили имя или прозвище Хритоня — производное от Христофора. Фамилия недворянская, бытовая, и её редкость говорит о том, что род мог быть немногочисленным или жить достаточно замкнуто.