Фамилия Хритонова женская, её мужской вариант — Хритонов. В основе лежит крестильное имя Хритон — просторечная, обиходная форма канонического имени Харитон. Переход «а» в «и» в безударной позиции — явление частое для русских говоров, особенно в северных и центральных областях, где «аканье» соседствовало с «иканьем». Так Харитон, сын Харитона, превращался в Хритонова.

Имя Харитон восходит к греческому «харис» — милость, благодать, красота. В святцах оно значилось как «благодатный». Но фамилия Хритонова фиксирует не столько значение имени, сколько живую народную фонетику: в документах XVII–XVIII веков встречаются написания и Хоритонов, и Хретонов, и Хритонов — это не ошибки, а отражение реального произношения в разных регионах.

Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Хритонов — буквально «сын Хритона». Такая модель — самая распространённая в русской фамильной системе, она охватила все сословия, от крестьян до дворян. Поэтому по одной фамилии социальный статус предков не определить — Хритоновы могли быть и крепостными, и мещанами, и священниками. Единственное, что можно сказать уверенно: фамилия оформилась не позднее первой половины XVIII века, когда патронимические прозвания на «-ов» стали закрепляться наследственно.

В отличие от фамилий на «-ин» (Харитошин, Хритошкин), которые образовывались от уменьшительных форм, Хритонов — от полного имени. Это указывает на то, что родоначальника звали Хритон официально, а не в бытовом сокращении. В современной России фамилия редкая, встречается точечно — в Тверской, Ярославской областях и на Урале, куда переселенцы принесли севернорусский говор с характерным «иканьем».