Фамилия Хроняра — редкая и нестандартная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не связано с исконно славянской моделью фамилий на -ов, -ин или -ский. Скорее всего, перед нами фамилия, пришедшая из другого языка или возникшая как прозвище, которое закрепилось в неизменной форме.

Самый вероятный источник — румынский или молдавский язык. В румынском есть слово «hrană» (еда, пища, пропитание). От него могло образоваться прозвище Hronar — «кормилец», «тот, кто добывает пропитание», или же человек, связанный с раздачей, хранением или приготовлением еды. Фамилия Hronaru (с определённым артиклем) встречается в Молдове и Румынии. Русская передача Хроняра могла появиться при записи на слух, когда конечное -u отпало или трансформировалось в -а по аналогии с женскими фамилиями. Также нельзя исключать, что -а на конце — это украинское или белорусское влияние, где фамилии часто застывают в форме родительного падежа или имеют окончание -а.

Менее вероятная, но возможная версия — греческое происхождение. В греческом языке «χρόνος» (хронос) означает «время». Прозвище Хроняра могло получить человек неторопливый, медлительный, либо, наоборот, пунктуальный. Однако фамилия с таким корнем и окончанием -ара больше тяготеет к балканскому ареалу.

Географически фамилия Хроняра, судя по скудным данным, привязана к юго-западу России, возможно, к регионам, граничащим с Украиной и Молдовой (Брянская, Курская области, Краснодарский край). Встречается она исключительно редко, что говорит о локальном бытовании, возможно, в пределах одной семьи или небольшого села.

Что касается социального контекста: носитель такой фамилии в XIX веке, скорее всего, был крестьянином или мещанином, а сама фамилия закрепилась не через священника или приказчика, а через устную традицию, как уличное прозвище. Дворянской династии с такой фамилией в России не было.