Фамилия Хронин — одна из тех, где сразу бросается в глаза необычная основа. В русском языке нет распространённого слова «хрон», и это первый ключ к разгадке. Скорее всего, перед нами не исконно русская фамилия, а адаптированная форма греческого имени или прозвища, пришедшая вместе с православием.

Самая вероятная версия — происхождение от крестильного имени Хрон (или Хроний). В святцах есть мученик Хроний, живший в IV веке. Имя восходит к греческому «хронос» — время. В народной среде такое имя могли дать и вне церковного календаря, например, ребёнку, родившемуся в необычное время или в преклонный срок у родителей. Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель: «чей?» — Хронин, то есть сын или потомок человека по имени Хрон.

Менее вероятная, но возможная версия — прозвище Хроня. В русских говорах слово «хроня» могло означать тихого, медлительного или задумчивого человека — от того же «хроноса», но уже в бытовом, ироничном смысле. Однако эта гипотеза слабее, потому что прозвище с таким корнем не фиксируется в диалектных словарях как устойчивое.

Фамилия Хронин встречается редко и имеет чёткую географическую привязку. По данным переписей и телефонных справочников, основные очаги — Тамбовская, Воронежская и Рязанская области, а также единичные случаи в Сибири. Это говорит о том, что фамилия могла распространиться из одного или нескольких родовых гнёзд в чернозёмной полосе, а не возникла стихийно в разных местах.

С точки зрения словообразования, фамилия Хронин стоит в ряду таких же редких «календарных» фамилий, как Вахонин, Федонин или Софронин. Все они образованы от греческих имён, которые редко давали в крестьянской среде, но иногда встречались у духовенства или в старообрядческих семьях. Поэтому предки Хрониных могли быть либо священнослужителями, либо старообрядцами, сохранившими более архаичные имена. Точных данных о сословии нет, но сама редкость имени Хрон указывает на нерядовое происхождение основателя рода.