Фамилия Хрынина — женская форма, а мужская, соответственно, Хрынин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Хрыня. Слово «хрын» в русских говорах имеет несколько значений, и от этого зависит, кем мог быть предок.

Самая вероятная версия отсылает к диалектному «хрын» — хрен, редька, а также переносно — старый, ворчливый человек, брюзга (сравните с «хрыч»). В этом случае фамилия образована по типичной модели: прозвище + суффикс притяжательности -ин (Хрыня → сын Хрыни → Хрынин). Такие прозвища давали либо по внешнему сходству (человек, похожий на корень хрена — коренастый, крепкий), либо по характеру (ворчливый старик). Вторая версия, менее распространённая, связывает «хрын» с растением хрен как огородной культурой. Тогда Хрыней могли прозвать огородника, торговавшего хреном, или человека, любившего острую пищу.

Фамилия редкая, географически тяготеет к центральным и южнорусским областям, где слово «хрын» фиксируется в говорах. Встречается в Тульской, Рязанской, Воронежской областях. Судя по модели образования, фамилия недворянская, крестьянская или мещанская. Интересная деталь: при переходе в письменную форму буква «ы» сохранилась — это указывает на древность прозвища, так как в более поздних фамилиях от того же корня часто писали через «и» (Хринин). То есть носители фамилии Хрынины — потомки человека, которого в XVI–XVII веках окрестили Хрыней за его характер или занятие.