Фамилия Хуббитдинова — яркий пример того, как арабское по происхождению имя прижилось на русской почве, обрастая местными суффиксами и окончаниями. В основе лежит мужское мусульманское имя Хуббитдин. Оно составное: первая часть «хубб» переводится с арабского как «любовь», а вторая — «дин» — означает «вера, религия». Вместе имя Хуббитдин (иногда встречается вариант Хуббиддин) можно понять как «любящий веру» или «любовь религии». Такие имена, прославляющие религиозные добродетели, были особенно популярны в среде татар и башкир, а также у народов Средней Азии.

Фамилия образовалась по классической русской модели: к основе имени (Хуббитдин) добавили русский патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Хуббитдина). Женский вариант Хуббитдинова — это грамматическая форма, закрепившаяся за носительницей. Таким образом, предок по мужской линии, вероятно, носил имя Хуббитдин, а его дети и внуки стали Хуббитдиновыми. Это типичный для татарских и башкирских фамилий путь: арабское или персидское имя, адаптированное через тюркскую среду, получает русское окончание.

Географически фамилия Хуббитдинова распространена в регионах с традиционно мусульманским населением — в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях. Встречается она и среди казахских семей, что объясняется общими исламскими корнями. Сословно предки носителей фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам, так как дворянские роды из подобных «восточных» имён формировались редко.

С точки зрения словообразования фамилия примечательна тем, что сохранила редкий корень «хубб», который в русском языке почти не встречается. Встречаются однокоренные фамилии — Хуббиев, Хуббатуллин, но Хуббитдинова стоит особняком из-за двойного согласного «т» в середине, что может указывать на конкретный диалектный вариант произношения имени. Несмотря на длину и кажущуюся сложность, фамилия прозрачна для этимологии: это отчество от мусульманского имени, которое носил основатель рода.