Фамилия Худальшеева — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранило почти первозданный вид и не обросло типовыми суффиксами вроде -ов или -ин. Перед нами не патроним (не «чей-то сын»), а притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чья?». Суффикс -ев здесь присоединился к основе, которая сама по себе уже была прилагательным среднего рода: «худо́е» (то есть плохое, негодное). Получается, что Худальшеева — это буквально «принадлежащая Худальшему» или, если точнее, «женщина из семьи Худальших».

Корень здесь — «худ-» в значении «плохой, дурной, некачественный». В древнерусском языке это слово имело широкий спектр значений: от «тощий, слабый» до «злой, лихой, бедственный». Усилительная частица «-льш-» (сравнительная степень: «худший» — «худо́льший») превращала прозвище в характеристику человека, которого считали самым неудачливым, слабым или несправедливо обиженным судьбой. Не стоит думать, что такое прозвище давали за реальные пороки — в крестьянской среде его могли получить и просто как оберег, чтобы злые силы обходили «худого» стороной, или как ироничное прозвище для сварливого, но безобидного человека.

Интересно, что фамилия не перешла в стандартную форму на -ов (Худальшеев), а осталась в женском роде. Это характерно для некоторых регионов, особенно для южнорусских и украинских земель, где фамилии на -а, -я давали по матери или по прозвищу матери, если она была более известна в округе. Впрочем, не исключён и вариант, что в основе лежит прозвище самой женщины — «Худальшая», то есть самая бедная или самая слабая в селе.

Аналогов среди однокоренных фамилий много: Худяков, Худов, Худенко, Худорожков. Но Худальшеева стоит особняком — её форма архаична и напоминает о тех временах, когда фамилия ещё не застыла в паспорте, а жила как живая характеристика человека, которую могли передать по наследству в неизменном виде. Носительница этой фамилии может с уверенностью сказать, что её предки были людьми прямыми — их прозвище не скрывало недостатков, а называло вещи своими именами.