Фамилия Худанин образована от прозвища Худаня, которое в старину выполняло так называемую «охранительную» функцию. Родители, желая уберечь сына от злых сил, нарочно давали ему «плохое» имя-оберег: считалось, что, назвав ребёнка Худаней, они обманут нечистую силу, которая не позарится на «худого» и слабого. Надеясь вырастить красивого, здорового и счастливого мальчика, они, по сути, желали обратного прозвищу, и этот приём был широко распространён у славян.

Со временем прозвище Худаня закрепилось за человеком как основное обиходное именование, а затем легло в основу фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Худанин — это «сын Худани», «из рода Худани». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я.

Стоит отметить, что корень «худ-» в древнерусском языке имел более широкий спектр значений, чем сегодня: он означал не только «тощий», но и «бедный», «слабый», «плохой». Поэтому прозвище Худаня могло отражать и внешность, и достаток, и характер человека. Однако именно «охранительная» версия выглядит правдоподобнее: в крестьянской среде имя-оберег защищало ребёнка от сглаза и болезней.

Безусловно, фамилия Худанин — самобытный памятник славянской культуры, сохранивший отголосок древних верований. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Худанин можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований, а пока мы можем уверенно разобрать её словообразовательную модель и ту народную мудрость, что стоит за этим именованием.