Фамилия Худис короткая, но её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет не русские, а балтийские или западнославянские корни. Окончание на -ис характерно для литовских и латышских фамилий, хотя встречается и у поляков, и у белорусов. Если перед нами литовский вариант, то в основе лежит слово chudas или kūdas — «худой», «тощий», «слабый». В Литве и сегодня есть фамилия Chudis (Худис), которая образована от прозвища по внешнему признаку.

Вторая версия — польская. В польском языке есть слово chudy с тем же значением «худой», а суффикс -ис мог появиться как русифицированная или полонизированная форма. В таком случае фамилия Худис — это вариант более распространённой польской фамилии Худы (Chudy) с изменённым окончанием. Такое переоформление часто происходило при переселении носителей на восток, в земли бывшей Речи Посполитой, где смешивались языки.

Редкий суффикс -ис в русских фамилиях почти не встречается. Это сразу выделяет Худис из ряда типичных «русских» фамилий на -ов, -ин или -ский. Если ваши предки носили эту фамилию, они, вероятно, происходили из западных губерний Российской империи — Виленской, Ковенской, Гродненской или Минской. Там фамилии на -ис не редкость, и они часто указывают на литовское или белорусское происхождение с польским влиянием.

Есть и менее вероятная, но возможная версия: связь с древнескандинавским именем Húð (Худ) — «шкура», «кожа». В эпоху варягов такие имена могли попасть в Новгородские земли, но тогда фамилия должна была бы звучать иначе — например, Худов или Худин. Поэтому эта гипотеза слабая, и её стоит отбросить.

В любом случае, фамилия Худис — не массовая. Её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а прозвище «Худой» давали человеку за худощавое телосложение. Никаких дворянских родов с такой фамилией в российских родословных книгах не зафиксировано.