Фамилия Худиш — редкая и неочевидная, её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от массовых фамилий на -ов и -ин, она принадлежит к другой, более древней модели. Ключ к разгадке — в суффиксе -иш, который характерен для юго-западных славянских земель, в первую очередь для украинской и белорусской ономастики. В польском языке этот суффикс часто встречается в прозвищах и фамилиях, образованных от личных имён или качеств. Поэтому логичнее всего искать корни фамилии не в великорусских говорах, а в западнорусских или польских.

Основа «Худ-» прозрачна: она восходит к прилагательному «худой». Однако в древнерусском и диалектах это слово имело более широкий спектр значений, нежели просто «тощий». «Худым» могли называть не только физически слабого человека, но и бедного, неимущего, а также того, кто был «худ» в смысле «плохой», «негодный», «злой». Вряд ли фамилия возникла как прямая характеристика внешности — скорее как прозвище по социальному положению (бедняк) или по характеру (недобрый, сварливый человек). Суффикс -иш в данном случае мог выполнять роль усилителя или указывать на принадлежность: «Худиш» — это «тот, кто относится к Худому» или «сын Худого».

Есть и вторая, более конкретная версия. Фамилия могла возникнуть как производная от прозвища «Худыш» или «Худиша» — так в некоторых говорах называли тщедушного, болезненного человека. Переход «Худыш» в «Худиш» объясняется фонетическими особенностями местных говоров или влиянием польской орфографии, где «sz» читается как «ш». В таком случае фамилия — это прямая, почти документальная характеристика, данная родоначальнику.

Географически фамилия Худиш сегодня встречается нечасто, но её концентрация заметна в западных областях России, Беларуси и на Украине. Это косвенно подтверждает её западнославянское происхождение. В польском языке существует фамилия Chudysz (Худыш), которая могла быть записана на русский манер как Худиш.

Поскольку фамилия недворянская и не имеет суффикса принадлежности (-ов, -ин), её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами. В сословном отношении это фамилия народная, «простого человека», что не умаляет её ценности как маркера семейной истории. Носителей фамилии с громкими титулами или известностью в истории не зафиксировано, и это нормально: такие фамилии — живые свидетели быта и языка тех, кто их носил.