Фамилия Хуишин — редкий случай, когда сразу видно, что перед нами не исконно русское образование, а запись иноязычной фамилии кириллицей. В русской модели фамилий нет суффикса -шин, который присоединялся бы к основе «Хуи-»: стандартный русский суффикс -ин дал бы «Хуин» (как в фамилии Хуин), а вариант -шин характерен для фамилий от основ на -ш (Иваш-ин → Ивашин, Фом-ин → Фомин, но не «Иваш-шин»). Здесь же мы видим цепочку «Хуиш-ин», где -ин — русский патронимический суффикс, но основа явно заимствованная.

Скорее всего, фамилия Хуишин — это русифицированная форма китайской фамилии. В китайском языке существует фамилия 惠 (Huì), которая в некоторых диалектах или при записи через европейские языки может передаваться как Hui. При добавлении русского суффикса -ин (по аналогии с фамилиями иностранцев, например, Чан-ин, Ли-ин) и возникает форма «Хуишин» — с характерной для кириллической передачи китайских слов вставкой ш перед суффиксом (ср. Мао Цзэдун → Маоин, но в некоторых вариантах — Маошин). Другой вариант: основа могла восходить к фамилии 许 (Xǔ), которая в старых транскрипциях передавалась как «Хуй» или «Хуи», но это менее вероятно из-за разницы в тонах.

Географически фамилия Хуишин встречается в России крайне редко, в основном на Дальнем Востоке и в Сибири, что подтверждает её происхождение от китайских переселенцев или потомков смешанных браков. В дореволюционных метрических книгах такая фамилия практически не фиксируется — она появилась, скорее всего, в советское время, когда китайские рабочие и эмигранты получали паспорта с русифицированными фамилиями.

Если же отбросить китайскую версию, то в русском языке основа «хуиш-» могла бы быть диалектным прозвищем от глагола «хуить» (в некоторых говорах — «бранить, ругать»), но это уже натяжка: слово «хуй» в значении «ругань» дало бы фамилию Хуев или Хуин, а не Хуишин. Таким образом, единственное логичное объяснение — китайское происхождение с последующей адаптацией через суффикс -ин.