Фамилия Хухаркин — редкий пример, где прозвище образовано от глагола со значением «жить в своё удовольствие». В основе лежит диалектное слово «хухаркать» или «хухрить» — так в северных и сибирских говорах называли человека, который делает что-то небрежно, кое-как, а чаще — того, кто ведёт праздный образ жизни, ленится, «хухрит» время. В некоторых местностях «хухря» — это неряха, замарашка, но с оттенком не злым, а скорее бытовым, беззлобным. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Хухаркин буквально значит «сын или потомок Хухарки», то есть человека с таким прозвищем.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. От основы «хухар-» (с чередованием корня хухр-/хухар-) образовано прозвище на -ка, что типично для русских народных имён: Хухарка. А уже от него — фамилия на -ин. Это характерно для северорусской и уральской традиции, где фамилии на -ин и -ых встречаются чаще, чем на -ов. В центральных и южных областях скорее появился бы вариант Хухарков, но закрепился именно Хухаркин — косвенное указание на географию происхождения.

Споров по этимологии почти нет. Версия о тюркских корнях (от слова «хух» или «хухар») маловероятна: фамилия не имеет характерных тюркских суффиксов, а звуковой облик полностью укладывается в русскую диалектную лексику. В словарях русских говоров (например, в «Словаре русских народных говоров») слово «хухрить» фиксируется в значении «бездельничать, плохо работать» — это и есть самая надёжная опора.

Социально фамилия Хухаркин, скорее всего, крестьянская или посадская. Прозвище давали в быту, без официального статуса, и закрепилось оно в тех семьях, где предок был известен своей нерадивостью или, наоборот, лёгким нравом — прозвища часто давали «от противного» с долей иронии. В дворянских или купеческих родах такая фамилия не встречается: слишком бытовая основа.

Сегодня носители фамилии рассеяны по России, но заметная концентрация — в Кировской области и Пермском крае, что подтверждает северное происхождение. Встречается также вариант Хухоркин, но он ещё реже. Написание через «а» — основное и исторически оправданное: в говорах аканье повлияло на форму.