Фамилия Кильдибеков образована от обрядового имени Кильдибек. Вероятно, оно состоит из двух основ: «кильди» и «бек». Первый корень восходит к татарскому имени Кильди, которое в переводе на русский язык означает «пусть родится; родился». Корень «бек» имеет значение «князь, повелитель, начальник, руководитель, глава, хозяин, господин». Изначально это слово употреблялось как древнетюркский военный термин, но с течением времени оно превратились в распространённый именной компонент. Вероятно, так родители нарекли долгожданного ребёнка, которому желали стать уважаемым и богатым человеком. Таким образом, потомок человека, которого звали Кильдибек, со временем получил фамилию Кильдибеков.