Фамилия Киляковы (и её мужская форма Киляков) ведёт начало от личного прозвища Киляк. Слово «киляк» в русских говорах неоднозначно, и это открывает сразу несколько версий происхождения фамилии, ни одна из которых не выглядит натянутой.

Самое прямое объяснение — от слова «кила». В старину килой называли грыжу или опухоль, а в переносном смысле — медлительного, слабосильного человека, плохого работника. Прозвище Киляк могли дать тому, кто из‑за болезни или телесного недостатка не мог справляться с тяжёлой работой. В крестьянском быту такие прозвища давали без злого умысла — скорее как бытовую примету.

Другая версия — от слова «кильё» (с ударением на второй слог). В некоторых говорах так называли старика, дряхлого человека. Тогда прозвище Киляк мог получить сын пожилого отца или сам пожилой человек, которого в шутку или по обычаю называли «киляком». Это объяснение встречается в работах по русской ономастике, хотя и реже, чем первое.

Есть и третья, менее очевидная версия. Киляк — это деталь струнных музыкальных инструментов, колышек, на который натягивают струну. Если предок был музыкантом или мастером по изготовлению гуслей, балалаек, скрипок, прозвище Киляк могло закрепиться за ним по роду занятий. Эта версия уступает по вероятности первым двум, но полностью исключать её нельзя, особенно если в роду сохранились предания о музыкантах.

Фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: прозвище на -як + суффикс принадлежности -ов. Суффикс -як в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, и обычно указывает на прозвищное происхождение (ср. Костяк, Пустяк, Рыжак). Форма Киляковы — это множественное число, обозначающее весь род, всех потомков человека по прозвищу Киляк.

Географически фамилия тяготеет к центральным и поволжским областям России, но точных данных о первичном ареале нет. В документах XVII–XVIII веков фамилия не прослеживается, что говорит о её относительно позднем закреплении — скорее всего, в среде крестьян и мещан, где фамилии окончательно оформились лишь к XIX веку.

Какая из версий верна для конкретной семьи, можно выяснить только через архивные записи: ревизские сказки, метрические книги, переписи. Но сам факт, что прозвище Киляк имело несколько значений, говорит о живом народном языке, в котором одно слово могло обозначать и внешность, и характер, и занятие.