Фамилия Кинахов держится на довольно прозрачной основе, но с неожиданным поворотом. Её ядро — имя или прозвище Кинах. В русской ономастике это краткая, разговорная форма от канонического имени Киндей. Само имя Киндей — редкий вариант греческого Евтихий (в переводе — «счастливый, удачливый»). В народе такие длинные имена часто урезали до двух-трёх слогов, и Кинах — один из таких живых остатков церковного имени.

Суффикс -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: Кинахов — «сын Кинаха», а со временем — потомок человека с таким прозвищем или именем. Фамилия образована по тому же принципу, что и Петров, Иванов, но с более редкой основой.

Интересна и другая версия, пусть и менее вероятная. В южнорусских и украинских говорах «кинах» могло быть искажением слова «кинах» или «кинак» — так в некоторых диалектах называли китайца или человека с узким разрезом глаз. Однако эта гипотеза слаба: фамилия Кинахов встречается в основном в центральных и северных областях России, где такие прозвища не были типичны. К тому же, в письменных источниках XVII–XVIII веков форма Кинах встречается именно как вариант имени, а не как этническое прозвище.

Географически фамилия не массовая. Основные очаги — Тверская, Ярославская и Костромская области. В этих краях имя Киндей было известно по святцам, но в быту его почти вытеснили более популярные имена. Поэтому Кинаховы — это, скорее всего, потомки семей, где имя Киндей передавалось по традиции несколько поколений подряд, пока не закрепилось в фамилии.

Фамилия не имеет отношения к дворянским родам — это типичная крестьянская или посадская фамилия, возникшая не позднее конца XVII века. В переписных книгах того времени встречаются крестьяне Кинаховы в вотчинах под Тверью. Позже, в XIX веке, фамилия почти не вышла за пределы своего региона, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если ваши предки Кинаховы, корни стоит искать в Верхневолжье.