Фамилия Кирдышев — один из тех случаев, где исходное слово почти исчезло из живого языка, а фамилия осталась. Её основа — «кирдык». В русских говорах и просторечии это слово означает «конец», «гибель», «капут» («пришёл кирдык»). Человек, получивший прозвище Кирдыш, мог быть либо человеком с тяжёлой судьбой (шутливое или горькое прозвище того, кто «дошёл до ручки»), либо, наоборот, тем, кто «доканывал», был задирой или не в меру настойчивым. В любом случае, это не комплиментарное, а скорее ироничное или бытовое прозвище — типичная черта русских неканонических имён.

Суффикс «-ев» указывает на принадлежность: Кирдышев — сын Кирдыша. Формально фамилия образована по стандартной патронимической модели, как Иванов, Петров или Смирнов, но основа у неё не крестильная, а прозвищная. В дореволюционных документах можно встретить вариант написания «Кирдышов» — через «о» после шипящего, что отражает живое произношение в некоторых говорах, но современная норма закрепила «е».

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, встречается в Поволжье и на Урале. Она не относится к числу распространённых, что говорит о локальном происхождении: прозвище Кирдыш было, видимо, редким, и фамилия не «размножилась» через массовое крестьянское население. В документах XIX века Кирдышевы могли быть как крестьянами, так и мещанами — сословная привязка по такой фамилии не прослеживается.

Любопытно, что слово «кирдык» тюркского происхождения (от «кырды» — «сломал», «уничтожил»), но в фамилии оно освоено русским языком уже как экспрессивное ругательство или бытовое выражение. В отличие от фамилий, образованных от тюркских имён (например, Кирдымов), здесь нет следов этнического прозвища — это чисто русское народное слово, ставшее прозвищем, а затем фамилией.

Если сравнивать с однокоренными, то Кирдышев стоит в одном ряду с Капутовым, Амбаровым или Шабашовым — все они образованы от слов со значением «конец». Но «Кирдышев» звучит органичнее, потому что «кирдык» в языке живёт до сих пор, а значит, носитель фамилии носит в ней отголосок живого народного юмора или крепкого словца.