Фамилия Киргизбекова — редкий пример, где в основе лежит не прозвище или профессия, а этноним, соединённый с тюркским титулом. Первая часть, «Киргиз», прямо указывает на народность, а вторая, «бек», в дореволюционной Средней Азии и Поволжье означала «господин», «князь», «предводитель». Получается, что исходное имя-прозвище Киргизбек можно перевести как «киргизский князь» или «бек из киргизов».

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий, пришедших из тюркской среды: к основе на согласный добавили русский суффикс принадлежности -ов, а затем типичное женское окончание -а. То есть Киргизбекова — это «дочь (или жена) Киргизбека». Мужской вариант фамилии — Киргизбеков.

Интересно, что такие составные имена из этнонима и титула были характерны для кочевой знати или уважаемых людей, которые хотели подчеркнуть и происхождение, и статус. В отличие от простых имён вроде Темирбек (железный бек), здесь первая часть привязывала человека к конкретному народу. Скорее всего, предок носителя фамилии был либо киргизом по происхождению, занимавшим высокое положение, либо получил такое имя в знак уважения к киргизским родам.

Фамилия почти не встречается в центральной России и сосредоточена в регионах с тюркским населением — в Татарстане, Башкортостане, а также в Казахстане и Киргизии. В русских документах XVIII–XIX веков такие фамилии фиксировались у служилых татар и башкир, которые сохраняли родовые имена, но оформляли их по русскому образцу. Споров о происхождении почти нет: версия с этнонимом и титулом единственная и логичная.