Фамилия Кирковец — одна из тех, что указывают на географическое происхождение предка. Её основа — топоним Кирково: так называются поселения на землях славян. Например, деревня Кирково есть в Тосненском районе Ленинградской области, а село Кирково — в Кырджалийской области Болгарии. Выходец из такого места получал прозвище Кирковец, которое со временем закрепилось как фамилия.

Сам топоним Кирково восходит к личному имени Кирко. Это краткая, обиходная форма двух крестильных имён: Кирилл и Кирьяк (церковное Кириак). Имя Кирилл переводят с греческого как «маленький господин», а Кириак означает «день Господний, воскресенье». В народной среде такие сокращения были естественны: полное имя упрощали до двух-трёх слогов, а от этого бытового варианта уже образовывали названия деревень.

Суффикс -ец в фамилии Кирковец — типичный для прозвищ переселенцев. Он отвечает на вопрос «откуда человек?»: кирковец — тот, кто из Киркова. По такой же модели образованы фамилии Ростовец, Томсковец, Могилевец. Встречаемость фамилии невысока, что тоже говорит в пользу её локального происхождения: предки, скорее всего, покинули одно конкретное село, а не несколько одноимённых.

Связывать фамилию напрямую с именем Кирилл и его носителем — святителем Кириллом, автором богословских толкований, — можно лишь через цепочку: имя → топоним → прозвище. Прямой связи с церковной историей фамилия не имеет, но в основе лежит то же имя, которое давали при крещении.