Фамилия Кисеьникова — редкий случай, когда написание выдает возможную региональную или диалектную особенность произношения. В основе, скорее всего, лежит слово «кисельник» — так в старину называли того, кто варит кисель, либо продавца киселя. Но форма на «-ьник» вместо привычного «-ник» («кисельник» → «кисеьник») наводит на мысль, что фамилия закрепилась в устной речи, где мягкий знак смягчил согласный, а на письме его сохранили. Это не ошибка, а живая фонетика.

Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Кисеьникова — «дочь (или жена) Кисеьника». Мужской вариант фамилии — Кисеьников. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от названий профессий или прозвищ. В отличие от фамилий на «-ин» (от основ на -а/-я), здесь использован притяжательный суффикс, характерный для основ на твердый согласный.

Кем был предок? Скорее всего, человеком, связанным с приготовлением или продажей киселя. В допетровской Руси кисель был повседневным, а не праздничным блюдом, поэтому «кисельник» — не самое высокое ремесло, но и не бранное прозвище. Встречаются также версии, что «кисельником» могли назвать вялого, медлительного человека (по аналогии с кисельной консистенцией), но для фамилии профессиональная версия надежнее.

Географически фамилия редкая. Основной ареал — центральные и северные области России, где кисель варили из овсяной муки. В южных регионах, где больше распространены фруктовые кисели, фамилия встречается реже. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) однокоренные «Кисельников», «Киселев» описаны как типичные «профессиональные» фамилии, но форма с мягким знаком — более локальный вариант.

Из-за редкости фамилии сложно говорить о сословной принадлежности предков. Скорее всего, это были крестьяне или посадские люди, а не дворяне: фамилии от ремесел редко закреплялись за высшими сословиями. В современных справочниках носители фамилии Кисеьникова почти не фигурируют, что подтверждает: это не массовая, а штучная фамилия, сохранившаяся в узком кругу семей.