Фамилия Кисенкова женского рода, а её основа чаще всего связана с мужским именем или прозвищем Кис. Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -енк- указывает на восточноукраинское или белорусское происхождение (сравните с фамилиями на -енко, где -енк- — вариант того же патронимического суффикса). То есть Кисенков — это буквально «сын Киса», а Кисенкова — соответственно, его жена или дочь.

Что могло лежать в основе имени Кис? Самая прямая версия — мирское имя от украинского «кiс» (чёрный дрозд). В народной традиции такие «птичьи» имена давали, чтобы ребёнок перенял от природы ловкость, певучесть или скрытность, а также чтобы защитить его от сглаза. Однако есть и другой, бытовой пласт: в русских говорах «киса» — это не только кошка, но и кошель, мешок с затяжкой, а также деньги и достаток. Прозвище Киса могли дать человеку хитрому, себе на уме, либо, наоборот, зажиточному, у кого «киса полна». Не исключено и профессиональное прозвище — мастера, который шил такие кожаные мешки.

Фамилия Кисенкова встречается нечасто, но географически привязана в основном к южным и западным регионам России, а также к Украине. В дореволюционных переписях её могли записывать и через «о» — Косенкова, если корень путали с «косой», но это уже другая ветвь. Спор между «птичьей» и «кошачьей» версиями решается в пользу первой: мирские имена от названий птиц в славянской ономастике встречаются гораздо чаще, чем прозвища от «кисы» в значении «кошка». Тем не менее, оба варианта имеют право на существование, и точное значение зависит от того, в какой именно местности и в какой семье фамилия закрепилась.