Фамилия Кистенюк — один из тех случаев, когда прозвище предка можно восстановить почти безошибочно. Корень здесь прозрачный: «кистень» — старинное холодное оружие, гирька на ремне или цепи, которой наносили внезапный удар. Суффикс -юк характерен для западнорусских и украинских земель (сравните: Костюк, Павлюк, Семенюк). Таким образом, Кистенюк — это «сын или потомок человека по прозвищу Кистень».

Прозвище Кистень могло закрепиться за человеком по разным причинам. Самый прямой вариант — воин, который умело владел этим оружием. В XVI–XVII веках кистень был распространён среди запорожских казаков и пограничной стражи, поэтому фамилия, скорее всего, имеет казацкие корни. Однако прозвище могло быть и ироничным: так могли прозвать драчуна, забияку или просто человека с тяжёлой рукой. Не исключён и третий, более редкий вариант — от слова «кисть» (рука) с тем же суффиксом, но это менее вероятно, так как форма «кистень» в русских говорах устойчиво связана именно с оружием.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые массово давали крестьянам после отмены крепостного права, Кистенюк — более старая, индивидуальная фамилия. Она фиксируется в реестрах Войска Запорожского и в метрических книгах Волынской, Подольской и Киевской губерний. Географически фамилия тяготеет к Правобережной Украине, а также к южным областям Беларуси (Полесье). Встречается и в России, куда её могли принести переселенцы в ходе столыпинской реформы или после революции.

Однокоренные фамилии — Кистенёв, Кистенко, Кистень — образуют гнездо, но Кистенюк стоит особняком благодаря суффиксу -юк, который указывает на украинскую или белорусскую языковую среду. Если ваш предок носил эту фамилию, он, вероятнее всего, был выходцем из казацкой или крестьянской среды западных земель, а сама фамилия досталась ему от воинственного или не в меру драчливого пращура.