Фамилия Кизейков — редкая и загадочная, её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от множества фамилий на -ов, образованных от канонических имён или профессий, основа «Кизейк-» явно нестандартна. Первое, что бросается в глаза — необычное сочетание звуков, которое может указывать на заимствованную или диалектную основу.

Скорее всего, в основе фамилии лежит прозвище Кизейка. Суффикс -ейк- характерен для русских народных говоров, особенно северных и сибирских, где он придаёт слову уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок (сравните: «зайка», «майка»). Само же слово «кизей» или «кизя» в русских диалектах имеет несколько значений. В одном из них «кизя» — это засохший навоз, который использовали как топливо (кизяк). Если прозвище Кизейка дали человеку, занимавшемуся сбором или продажей такого топлива, то фамилия получила бы сугубо бытовое, «низовое» происхождение. Однако такое объяснение кажется слишком прямолинейным и не учитывает возможной иноязычной подоплёки.

Более перспективна версия, связывающая фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «кизик» (в разных вариантах произношения), означающее «маленький», «младший», «детёныш» или «кусочек». В татарском, башкирском или казахском языках «кызык» также может означать «интересный», «забавный». Прозвище Кизейк (с озвончением конечного согласного) могло даваться младшему сыну, невысокому человеку или, в переносном смысле, — забавнику, шутнику. Суффикс -ов в таком случае просто русифицировал тюркское прозвище, что типично для фамилий Поволжья, Приуралья и Сибири, где русские и тюркские народы веками жили рядом.

Третья, менее вероятная версия — связь с календарным именем Козьма (Кузьма) через диалектное «Кизей». В некоторых говорах звук «з» мог переходить в «с» или «ц», а «м» в «й» (ср. Кузьма — Кузя). Однако цепочка Кузьма → Кизейка → Кизейков выглядит натянутой, и такая модель образования для фамилий на -ов нехарактерна.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что фамилия Кизейков имеет тюркскую основу и была образована от прозвища, данного по возрасту, росту или характеру. Географически её стоит искать в регионах активных русско-тюркских контактов: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской или Челябинской областях. Это фамилия, в которой сплелись языковые традиции, и её носители, скорее всего, потомки людей, живших на стыке культур.