Фамилия Кизил — один из примеров, как тюркское слово стало основой для русской фамилии. В ряду знаменитых фамилий тюркского происхождения — Тургенев (от «турген» — быстрый, скорый), Аксаков (от «аксак» — хромой), Булгаков (от «булгак» — беспокойный) — Кизил стоит особняком. Основа здесь — тюркское «кызыл», что значит «красный». Это могло быть прозвище по цвету волос, румянцу или одежде, но чаще всего так называли смуглого или рыжеватого человека. В некоторых тюркских языках «кызыл» также имело переносное значение «красивый, яркий», так что прозвище могло быть и комплиментарным.

Фамилия образована по русской модели: к основе «Кизил» присоединили нулевой суффикс (так называемая «чистая» основа без типичных -ов/-ев или -ин). Такая модель встречается реже, чем суффиксальная, и характерна для поздних фамилий, которые закрепились в документах уже в XVIII–XIX веках. Скорее всего, предок носителя фамилии получил прозвище Кизил в устном общении, а при переписи или записи в метрическую книгу его записали без изменений — так, как слышали.

Географически фамилия тяготеет к южным регионам России и Поволжью, где исторически было сильное тюркское влияние, а также к местам расселения казачества. Там тюркские прозвища были обычным делом. Встречается фамилия и у татар, и у русских, что говорит о межэтническом бытовании основы. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» тюркские основы, включая цветовые, разбираются подробно, и Кизил вписывается в эту группу как пример прозвища по внешнему признаку.

Спорных версий здесь немного: иногда Кизил путают с названием южного кустарника кизил, но это случайное созвучие. Ягодное название вряд ли стало бы прозвищем человека — для тюркских языков «кызыл» означает именно цвет, а не растение. Поэтому основная и единственная правдоподобная версия — прозвище по красному оттенку во внешности.