Фамилия Кльчурина — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает исходное слово. На слух она звучит как «Клычурина», и именно в этой фонетической форме и кроется разгадка. Скорее всего, в основе лежит прозвище Клычур или Клычура, образованное от диалектного слова «клыч» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли клык, длинный зуб, а иногда и острый колышек или торчащий сук. Суффикс -ур(а) в русских прозвищах придавал слову грубоватый, насмешливый оттенок (сравните: «кривуля», «загогуля», «чистюля»). Таким образом, Клычурой могли прозвать человека с приметным, выдающимся зубом, а может, и просто ершистого, колючего по характеру.

Женская форма Кльчурина — это притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чья?». В русской традиции так называли жену или дочь человека по фамилии Кльчурин (или по прозвищу Кльчура). В документах XVII–XIX веков фамилии с таким окончанием часто фиксировались именно в женском роде для обозначения вдовы или незамужней дочери, а затем закреплялись как наследственные. Встречается она крайне редко, преимущественно в областях бывшего проживания однодворцев — потомков служилых людей на южных границах России, где фамилии на -ин и -их были особенно распространены.

Словообразовательная модель здесь нестандартна: в корне произошла замена ы на ь («Клычура» → «Кльчура»), что характерно для старого бытового произношения или ошибок при записи фамилии в церковных книгах. Такое смешение гласных — верный признак того, что фамилия не книжная, а живая, деревенская. Если бы её записывал грамотный писец, мы бы видели «Клычурина». А «Кльчурина» — это народная фонетика, застывшая на бумаге.

Связывать фамилию с тюркским словом «клыч» (меч, сабля) можно, но маловероятно: в русских фамилиях тюркские заимствования обычно сохраняют значение оружия лишь в виде прямых прозвищ (Клычов, Клычев), а суффикс -ур(а) для них нехарактерен. Куда правдоподобнее, что предок носителя этой фамилии был просто человеком с заметной улыбкой или острым языком — прозвище Клычура закрепилось за ним, а потом перешло к потомкам в виде редкой фамилии Кльчурина.