Фамилия Кленницкий, как и многие польские и западнорусские фамилии на -ский, указывает на географическое происхождение. Скорее всего, её получил выходец из местечка Кленница (сегодня — агрогородок в Минской области), либо из другой местности с похожим названием — Клены, Кленцы. Такие топонимы встречаются на территории современных Беларуси, Польши и Украины, и все они связаны с клёном: либо с рощей этих деревьев, либо с поселением, основанным у кленового леса.

Суффикс -ский в этой фамилии не просто указывает на связь с местом, а характерен для шляхетских фамилий Речи Посполитой. Носитель фамилии Кленницкий мог быть не крестьянином, а мелким дворянином, владевшим землёй в окрестностях Кленницы. Впрочем, со временем фамилия распространилась и среди других сословий — по мере того, как люди переезжали в города или теряли связь с родовым имением.

В русском языке фамилия сохранила польское окончание -цкий, а не перешла в более привычное -ский. Это дополнительная примета того, что предки носителя фамилии происходили с западных земель, где ойконимы на -ица (-ница) давали фамилии именно на -ицкий. Встречается и вариант написания Кленицкий — с одной буквой «н», что отражает местное произношение или описку в документах.

Итак, корень фамилии — клён, суффикс -ниц- указывает на принадлежность к местности, а окончание -кий — на происхождение оттуда. Буквально: «тот, кто из Кленницы».