Фамилия Кляин — это, скорее всего, русифицированный вариант немецкой фамилии Кляйн (Klein). Основное значение — «маленький». В Германии такое прозвище давали невысокому человеку, и оно закрепилось как фамилия. В России, куда немцы переселялись в XVIII–XIX веках, окончание -ин пришло на смену немецкому окончанию, подчинив фамилию русской грамматике: Кляйн превратился в Кляин, и теперь склоняется как «Кляин — Кляина — Кляину».

Интересно, что в немецком языке прилагательное klein могло использоваться не только для роста, но и для обозначения младшего в семье или человека незнатного происхождения. Поэтому предок-носитель фамилии мог быть просто младшим сыном или выходцем из низов. Встречается и другой, менее вероятный вариант: что фамилия образована от диалектного русского прозвища, но немецкое происхождение подтверждается историей миграции и типичной моделью адаптации.

Географически фамилия Кляин чаще всего встречается в Поволжье и на юге России — в регионах, куда в XVIII веке по приглашению Екатерины II массово заселялись немецкие колонисты. Со временем, особенно в советский период, многие носители сменили написание на более «русское» или переделали фамилию обратно в Кляйн, поэтому сегодня Кляины — относительно редкая ветвь этого рода.